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Arrêt maladie de vos salariés : le certificat électronique arrive sur MyGuichet.lu — comment l'activer dans votre espace professionnel

Le certificat d'incapacité de travail passe à l'électronique au Luxembourg. Comment l'activer sur MyGuichet.lu et ce qui change pour votre entreprise.

Publié le 30 septembre 2026 · Lux-Office

Trois exemplaires papier, un envoi postal à la Caisse nationale de santé, un autre à l'employeur, un délai de trois jours à respecter : la gestion des arrêts maladie reste, pour beaucoup de PME luxembourgeoises, une source de paperasse et parfois de retards. Le Luxembourg fait évoluer le système avec un certificat d'incapacité de travail électronique (eCIT), établi directement par le médecin. Voici comment l'employeur doit s'organiser pour en profiter.

Un certificat établi électroniquement dès la consultation

Avec l'eCIT, le certificat d'incapacité de travail est établi au format électronique dès sa rédaction par le médecin, à condition que celui-ci soit établi au Luxembourg et utilise ce système. Le salarié peut alors transmettre son certificat directement via MyGuichet.lu, à la fois à la Caisse nationale de santé (CNS) et à son employeur. Le système s'appuie sur la vérification GouvCheck, ce qui supprime le risque de falsification à la source.

Ce que l'employeur doit activer sur MyGuichet.lu

Pour recevoir les certificats électroniques de ses salariés, l'employeur doit effectuer une manipulation simple mais indispensable dans son espace professionnel MyGuichet.lu :

Sans cette activation, l'entreprise ne pourra pas recevoir les certificats sous forme électronique et devra continuer à fonctionner uniquement avec le format papier.

Les délais légaux ne changent pas

Le passage à l'électronique ne modifie pas les délais que salariés et employeurs doivent respecter :

Le papier reste possible, sous conditions

Le salarié peut toujours demander à son médecin un certificat imprimé en trois exemplaires et signé, qu'il devra alors transmettre lui-même à son employeur et à la CNS par voie postale, comme auparavant. La voie électronique suppose en effet trois conditions cumulatives : que le médecin soit établi au Luxembourg, qu'il utilise le certificat électronique, et que le salarié transmette son certificat via MyGuichet.lu. Les deux circuits, papier et électronique, coexistent donc pour l'instant.

Un gain de temps pour la gestion RH au quotidien

Au-delà de la simplification pour le salarié, le passage à l'électronique présente un intérêt direct pour l'employeur : plus besoin d'attendre un envoi postal, de classer un document papier ou de relancer un salarié qui aurait oublié de transmettre son certificat dans les délais. La réception se fait directement dans l'espace professionnel MyGuichet.lu, ce qui facilite le suivi des absences et la coordination avec le service qui gère la paie. Pour les petites structures sans service RH dédié, c'est un point de moins à gérer manuellement chaque mois.

Ce qu'il faut retenir

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